La consanguinité était une norme dans la famille des Habsbourg, en particulier pour Marie-Antoinette d'Autriche : son coefficient de consanguinité était de 0,3053, soit supérieur à celui d'un enfant dont les parents sont frère et sœur. Elle n'avait que 10 arrière-arrière-arrière-grands-au lieu de 32.

Son père était l'oncle maternel de sa mère mais aussi son cousin germain paternel. De plus, ses grands-parents et arrière-grands-parents maternels étaient oncle et nièce.